돼지 생식기 호흡기 증후군(PRRS) 방제 전략은 바이러스 유입 위험이 가장 높은 경로를 정확하게 파악하여 가장 적절한 조치의 우선순위를 정하는 것이 가장 효과적입니다. PRRSV의 전파 기전은 확립되었지만, 주로 PRRSV-1보다는 PRRSV-2가 우세한 지역(예: 북미)에서 발견됩니다.

영국은 북미와 달리 돼지 산업 및 축산 관행의 구조와 규모가 다릅니다. 영국은 농장 규모가 작고, 돼지 밀도가 낮으며, 실외 사육 시설도 더 많습니다. 현재까지 영국 돼지에서 PRRSV-1만 검출되었으며, 영국 내 PRRSV 확산에 있어 다양한 전파 경로의 상대적 중요성을 정확하게 보여주는 자료는 거의 없습니다.

영국 동물식물보건국(Animal and Plant Health Agency) 소속 JP Frossard와 동료들이 수행한 연구의 목적은 영국 농장에서 발견된 PRRSV-1의 유전적 유사성을 바탕으로, 지리적 근접성과 돼지 이동을 통한 농장 간 연계가 PRRSV 확산에 미치는 영향을 평가하는 것이었습니다. 이 연구 결과는 2024 북미 PRRS 심포지엄에서 발표되었습니다.

2014년부터 2020년까지 영국에서 제출된 진단용 PRRSV-1의 ORF5 염기서열 567개를 분석하여 데이터세트를 구축했습니다. 염기서열 쌍별 비교를 통해 염기서열 쌍 간 거리와 유사도 비율을 상세히 분석했습니다. 각 염기서열은 사육장 식별자와 지리적 기원을 기준으로 할당되었습니다. 이 정보는 사육장을 제출일 기준 2년 동안의 가축 인구 통계 데이터 그룹(Livestock Demographic Data Group) 돼지 이동 데이터와 연결하는 데 사용되었습니다. 이 데이터는 추정된 사육장 규모 및 사육장 유형, 2년 동안 이동된 돼지 수, 돼지를 입식한 사육장 수, 그리고 해당 사육장이 대규모 돼지 사육장의 일부로 식별 가능한지 여부에 대한 정보를 추출하는 데 사용되었습니다.

567개의 시퀀스 중 265개의 고유한 농장이 확인되었으며, 농장당 1개에서 21개의 시퀀스가 포함되었습니다. 농장들은 일반적으로 영국 돼지의 지리적 분포를 대표했으며, 대다수(88.7%)는 규모가 가장 큰 범주에 속했으며, 비육용 또는 종축-비육용 농장이었습니다.

유사 시퀀스의 비율은 농장 내 공급업체 수와 돼지 이동에 영향을 받았습니다. 이동 횟수가 많은 곳(온/오프)은 시퀀스 다양성이 유의미하게 높았는데, 이는 농장 내 신종 균주 전파가 더 활발했음을 시사합니다. 고유 공급업체가 적은 농장일수록 일반적으로 유사한 시퀀스를 더 많이 보였습니다. 동일 회사의 시퀀스를 분석했을 때, 17개 농장 중 4개 농장만 유사한 시퀀스를 가질 가능성이 유의미하게 높았는데, 이는 단순히 회사 또는 생산 피라미드 내에 있는 것이 돼지의 직접적인 이동과 공급업체 이용만큼 시퀀스 다양성에 영향을 미치지 않음을 시사합니다.

지역 확산 가능성을 조사한 결과, 14개 군 중 10개 군은 지역 내 유사성이 지역 외부보다 더 컸습니다. 이 결과는 돼지 이동의 정도와 출처의 수가 농장 내 서열 다양성에 영향을 미쳤음을 시사합니다. 또한, 지역 내 서열의 유사성이 다른 지역보다 더 크다는 점에서 대규모 지역적 영향도 강조됩니다. 이는 농장 내 공급자 수를 줄이고 지역 외부로의 이동을 줄이는 것이 영국 내 PRRSV-1 균주 확산을 줄이는 데 도움이 될 수 있음을 시사합니다.